Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VWC2Q2TAL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VWC2Q2TAL6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms