Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms