Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNOP1Q1ED39 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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