Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms