Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FXNQ16595 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FXNQ16595 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FXNQ16595 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FXNQ16595 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FXNQ16595 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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