Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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