Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITSN1Q15811 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITSN1Q15811 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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