Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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