Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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