Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms