Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCAPHQ15003 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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