Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GINS1Q14691 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GINS1Q14691 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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