Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC1AQ14683 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
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