Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCARF1Q14162 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms