Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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