Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C1DQ13901 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms