Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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