Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX3Q13185 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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