Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BNIP1Q12981 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms