Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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