Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUDPQ08623 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms