Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF85Q03923 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF85Q03923 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms