Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms