Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLOD1Q02809 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1008.9 ms