Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN7AQ01118 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SCN7AQ01118 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms