Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRCDQ00LT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms