Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF9Q00978 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms