Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDPQ00604 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDPQ00604 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDPQ00604 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDPQ00604 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDPQ00604 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDPQ00604 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms