Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDLBPQ00341 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDLBPQ00341 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms