Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD1P98174 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD1P98174 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD1P98174 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FGD1P98174 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGD1P98174 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGD1P98174 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGD1P98174 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms