Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms