Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTD2P86397 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTD2P86397 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HTD2P86397 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTD2P86397 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HTD2P86397 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HTD2P86397 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HTD2P86397 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTD2P86397 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTD2P86397 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTD2P86397 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HTD2P86397 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HTD2P86397 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HTD2P86397 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HTD2P86397 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms