Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX3P78415 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX3P78415 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX3P78415 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms