Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms