Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPM4P67936 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM4P67936 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM4P67936 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM4P67936 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPM4P67936 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPM4P67936 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPM4P67936 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPM4P67936 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms