Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERVK_113P61574 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms