Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1P60507 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms