Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00310P59036 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms