Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA9P57773 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA9P57773 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA9P57773 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA9P57773 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA9P57773 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA9P57773 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA9P57773 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA9P57773 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA9P57773 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms