Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCKAP1LP55160 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKAP1LP55160 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms