Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBX1P52954 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LBX1P52954 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBX1P52954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBX1P52954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms