Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms