Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDST1P52848 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDST1P52848 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDST1P52848 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDST1P52848 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms