Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms