Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC34P49427 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC34P49427 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC34P49427 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC34P49427 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC34P49427 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC34P49427 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC34P49427 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms