Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NESP48681 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NESP48681 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NESP48681 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NESP48681 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NESP48681 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NESP48681 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NESP48681 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
NESP48681 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NESP48681 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NESP48681 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NESP48681 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NESP48681 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NESP48681 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NESP48681 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NESP48681 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NESP48681 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NESP48681 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NESP48681 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms