Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms