Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CAP42336 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.2 ms