Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC5P40937 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC5P40937 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC5P40937 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC5P40937 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC5P40937 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC5P40937 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC5P40937 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC5P40937 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC5P40937 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC5P40937 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms