Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 CWH41YGL027C 2502 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ARP9YMR033W 1404 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RRP14YKL082C 1305 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ATP22YDR350C 2055 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RPN3YER021W 1572 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 PRE1YER012W 597 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YOR050CYOR050C 348 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 BAG7YOR134W 1230 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YDR186CYDR186C 2634 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 MAK5YBR142W 2322 nt2.67□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 STE11YLR362W 2154 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 SLY41YOR307C 1362 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 HMO1YDR174W 741 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 LSM8YJR022W 330 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 TPT1YOL102C 693 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 THI80YOR143C 960 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YKR078WYKR078W 1758 nt2.66□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 DSE1YER124C 1722 nt2.65□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 UTP15YMR093W 1542 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 snR68snR68 136 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 TCA17YEL048C 459 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 COBQ0105 1158 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MPC1YGL080W 393 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 RPA12YJR063W 378 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PAU23YLR037C 375 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ERV41YML067C 1059 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YOL114CYOL114C 609 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 DPB3YBR278W 606 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 AI4Q0065 1671 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PDR11YIL013C 4236 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 BNR1YIL159W 4128 nt2.65□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MLH1YMR167W 2310 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 AVT5YBL089W 1380 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SVL3YPL032C 2478 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 GEA1YJR031C 4227 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 AI3Q0060 1248 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YEL057CYEL057C 702 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 UPF3YGR072W 1164 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 BAT1YHR208W 1182 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 BET3YKR068C 582 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 INO4YOL108C 456 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PNO1YOR145C 825 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SRL1YOR247W 633 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ATG29YPL166W 642 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 LTP1YPR073C 486 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ICR1ICR1 3199 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MSH4YFL003C 2637 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SSN2YDR443C 4263 nt2.64□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 GCD2YGR083C 1956 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 RPL17BYJL177W 555 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MST28YAR033W 705 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SAS2YMR127C 1017 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PEX15YOL044W 1152 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 CSH1YBR161W 1131 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SLN1YIL147C 3663 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PHO91YNR013C 2685 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YDR239CYDR239C 2364 nt2.63□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YBR259WYBR259W 2067 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 NUP170YBL079W 4509 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 FMN1YDR236C 657 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 RGI1YER067W 486 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YGL159WYGL159W 1113 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 NNF1YJR112W 606 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 TSR4YOL022C 1227 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 IRC13YOR235W 315 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YOR387CYOR387C 621 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 CCL1YPR025C 1182 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YBR292CYBR292C 372 nt2.62□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 VPS13YLL040C 9435 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YDR124WYDR124W 975 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 GSP1YLR293C 660 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PML39YML107C 1005 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 SUB1YMR039C 879 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MRPL33YMR286W 261 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 FMP41YNL168C 780 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 UBS1YBR165W 834 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YNL011CYNL011C 1335 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 BI3Q0115 1554 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 BOI1YBL085W 2943 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MSB1YOR188W 3414 nt2.61□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 POL4YCR014C 1749 nt2.6□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 APC11YDL008W 498 nt2.6□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 MFA1YDR461W 111 nt2.6□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ARG3YJL088W 1017 nt2.6□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 VHR1YIL056W 1923 nt2.6□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 AVT2YEL064C 1443 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 DUG2YBR281C 2637 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 VTC3YPL019C 2508 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 UBC9YDL064W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 PLP1YDR183W 693 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 HYP2YEL034W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.5 ms